Below is a summary of the number of UCNEs found in different species forming a corresponding genomic regulatory block.

Cluster nameHumanMouseOpossumPlatypusChickenZebra_finchLizardPainted_turtleXenopusFuguMedakaSticklebackTetraodonZebrafish
ZEB2_cluster1341331341321341331301261166747405645
EBF3_cluster9696899496959688914848474862
TSHZ3_cluster9696969696959689905246573863
BCL11A_cluster9292909292928887622631302350
FOXP2_cluster8383838383838365785842595467
ZFHX4_cluster7979796279777966783635373058
DACH1_cluster7373717373737262543633303535
ESRRG_cluster7272727272727267651819241050
NPAS3_cluster717171717171706929991639
NR2F1_cluster6767666767676661513634393240
MEIS2_cluster6767675267676760525148514228
IRXB_cluster6060605960606055483737413035
ZNF503_cluster6060586060606057374543464244
TSHZ1_cluster595959555959595593027282928
NR2F2_cluster5757565657565553542624272435
FOXP1_cluster4949494949484745443023283030
MEIS1_cluster454545454545444541221402125
POU3F3_cluster4444444444434242379184324
FIGN_cluster4444444444424439362423262419
BNC2_cluster4343434343434242382426252417
PBX3_cluster4242424242414040343234353031
POU3F2_cluster42424240424242393498989
RUNX1T1_cluster414141414141413834131112917
TLE4_cluster41404139414141393910000
ZNF521_cluster40404037404039356201918146
LMO4_cluster4040404040404038361715181422
SATB1_cluster3737373737373733341412171514
NR4A2_cluster3737373737353733362928302821
OTP_cluster3535343435353532332221202224
TFAP2A_cluster3434343434343333321922201620
AUTS2_cluster3434331334343133321317191316
SALL3_cluster3333332933333330311926241918
ZFPM2_cluster3333333333333331292828272828
PAX6_cluster3333333333333333306810922
PAX9_cluster32323232323232242211711715
PROX1_cluster313131313131312830685318
IRXA_cluster3131313131313130302524252022
ZFHX3_cluster313131313131222924656610
LMO3_cluster3030302630303026110815019
HOXD_cluster3030303030302929292321232219
SOX2_cluster29282929292929282799111117
SP3_cluster2828282828282826281818181613
BHLHE22_cluster2828282828282825261214131314
EBF1_cluster272727272727272619223411
ZIC1_cluster2727272627272726221314131113
SOX6_cluster2727272727272726151315151319
BARHL2_cluster2626242626262623251718171119
SOX5_cluster262626262626252415676710
FOXD3_cluster2525242525222525231817161716
POU4F1_cluster2525252525252522259811811
VTI1A_cluster2424242424242421201815111618
HOXA_cluster24242424242424242433536
SIX2_cluster222222192222222221577513
PITX2_cluster2222222222222221219912811
SMAD3_cluster212121212119212119121112119
PTBP2_cluster21212121212121201711316
VRK1_cluster2121212021212121207912614
EMX2_cluster2020202020202016141615181117
KLHL14_cluster2020202020202016201091079
SP8_cluster2020202020202020191110111111
WWOX_cluster2020202020201919191210101210
FOXG1_cluster19191919191919181101009
NFIA_cluster19191817191918181802726
MECOM_cluster19191919191919191881313410
SHOX2_cluster1919191919181917191616141513
NKX6-1_cluster19191816191918191915721417
CASZ1_cluster191916191919817161311121211
TSHZ2_cluster181818181818181718111011108
POU4F2_cluster181818181818181716139131115
ZNF238_cluster181818181818181615544311
OTX2_cluster18181718181818171775675
LHX1_cluster171717171717171414888911
MAB21L2_cluster17171717171717161598999
TOX_cluster17171717171717161500005
POU6F2_cluster17151717171716171711101199
GBX2_cluster1717917171717161376168
ARX_cluster16161614161616141664558
TCF4_cluster1616161616616121511303
ODZ3_cluster16161614161616151534335
PRDM8_cluster161616141616161416141231213
OTX1_cluster16161616161616141658459
DACH2_cluster151514141515151515000010
PAX2_cluster1515121315151513151412131413
BCL11B_cluster15151515151513131447737
TFAP2B_cluster14141414141414141345658
HMX2_cluster1414141414141414131110111010
FOXB1_cluster14141414141411141175666
ISL1_cluster131313131313131313538110
LHX9_cluster12121211121212128777410
MAB21L1_cluster12121212121212121189986
TLX3_cluster121212101212128700000
SATB2_cluster12121210121212111011001
LBX1_cluster12121212121212121233233
ID4_cluster12121211121211121133333
ZIC2_cluster12121212121212121287889
ST18_cluster11111111111111111186888
ETV1_cluster11111111111111101155645
PAX5_cluster1010101010101010910000
NFIB_cluster10101010101010101034421
TBX2_cluster1010101010101091046779
ZNF608_cluster10108101010109700000
POU3F4_cluster10101081010109921320
LHX2_cluster99999999955644
PRDM13_cluster99999999922224
TNFAIP3_cluster99999999867736
LRPPRC_cluster99989998922124
SOX14_cluster99999988977667
KIF14_cluster99999999644358
SOX21_cluster99999997878885
CADM1_cluster99979989201002
SYNCRIP_cluster88888888713314
ZNF703_cluster88788788866655
GSX1_cluster88888888844444
DLX1_cluster88888888777776
VPS13B_cluster88888888732330
DDX3X_cluster88888888843513
ONECUT1_cluster88878808811115
DHX15_cluster88888888533312
MICALL2_cluster88778838865567
TMEM114_cluster88888877620014
DRGX_cluster88888888675767
LACE1_cluster88888888833232
RNF144A_cluster77777777633333
MEF2C_cluster77777677733323
MIR4796_cluster77757777700000
ELTD1_cluster77777777622321
PHOX2B_cluster77777757755555
PBX1_cluster77757776525524
RNF220_cluster77677776753447
PAX1_cluster66666666654455
PPIC_cluster66666665622122
FBXO8_cluster66666666600002
GLI3_cluster66666666652545
MIR4307_cluster66666666400000
MIR4318_cluster66666665500000
SMAD2_cluster66566665602215
NEUROD6_cluster66666666632314
TANK_cluster66666666633333
ESRRB_cluster66666666254445
FAF1_cluster66666665621312
CELF2_cluster66666656633334
GATA3_cluster66666656664366
CHD7_cluster55555555511114
GXYLT1_cluster55055545511110
EN1_cluster55515555032333
EBF2_cluster55535555222221
SP5_cluster55555555555555
TFAP2B_cluster55555555512120
ZSWIM6_cluster55545555511210
MSI2_cluster55555544433234
TNPO1_cluster55545555521214
AK5_cluster55555555532331
ZC3H3_cluster55545555401211
OLIG2_cluster55555455501101
POLR3B_cluster55555555533333
TRPS1_cluster55555555500003
ZIC3_cluster55555425534444
EYA1_cluster55555555543434
HDAC9_cluster55555555533332
ZBTB16_cluster55535555444424
KCTD15_cluster44444444433323
LMO1_cluster44444444432333
ZNF423_cluster44444444401111
MARCKS_cluster44444444433331
CUX1_cluster44444434300001
AFF3_cluster44444444100000
GMDS_cluster44444444301110
CELF4_cluster44444444300000
MYT1L_cluster44444444444434
PTF1A_cluster44444444433334
LUC7L3_cluster44444444343344
BARHL1_cluster44444404421002
ANXA1_cluster44444444400001
BAZ2B_cluster44444444432322
MBD5_cluster44444444111102
TEAD1_cluster44444444434423
DIP2C_cluster44444444300000
DBX1_cluster44444422131234
HHIP_cluster44444444423223
CADPS2_cluster44444444410102
SOX1_cluster44434444422222
DCAF12L2_cluster44444444400000
NTM_cluster44444444200000
DPH1_cluster44334434211111
NCOA2_cluster44434444421313
UBE2E3_cluster44444444300002
GSX2_cluster44444444443222
SAR1B_cluster44444444401111
SOX3_cluster44444444422333
MBNL1_cluster44444444433332
G2E3_cluster44444444111112
FLJ42709_cluster44444444233313
CADPS_cluster44444444323323
ARL15_cluster44444444321221
CPEB2_cluster44444444421121
CDK14_cluster44414444400000
NRXN3_cluster44444444311112
RARB_cluster44444444410100
NIPBL_cluster44444444222222
KCNS3_cluster33233333200000
CTBP2_cluster33223333011110
NKX6-2_cluster33133333331231
QKI_cluster33333331301110
LPHN2_cluster33333333200000
HOXB_cluster33333233311102
ARID5B_cluster33333333200001
EGR2_cluster33333333311112
ZMIZ1_cluster33333333111111
ARID1B_cluster33333333011210
GAS1_cluster33323333322222
ODZ2_cluster33333333300001
POU3F1_cluster33333333333133
SLIT2_cluster33333333300000
CPEB4_cluster33333331332333
MIR205HG_cluster33333333200000
FHIT_cluster33333333100000
WNT5A_cluster33333323100000
SRSF11_cluster33333333333333
DLX6_cluster33223323322222
NRIP1_cluster33133332201102
MAFB_cluster33333333201011
ERBB4_cluster33333333300000
XPO1_cluster33333332333312
NRXN1_cluster33333332300000
TSG1_cluster33333333211110
MLLT10_cluster33333332310111
HNRNPD_cluster33333333311211
PTPRD_cluster33333333322222
TCF12_cluster33333333322223
LMBR1_cluster33333333333333
CUX2_cluster33333333333331
DBX2_cluster33233333311210
DMRT2_cluster33333333333333
SLC10A2_cluster33333333200000
SOX1_cluster33333333322213
FLJ45079_cluster33333333000000
IKZF1_cluster33333333333333
LIN52_cluster33333333322221
FOXB2_cluster22222222222222
ONECUT2_cluster22222022200000